بدربار محمود شتافتند و چون مقصود اصلى محمود ابو على بود با بو نصر عراق كه نقاش ماهرى بود دستور داد كه تصوير شيخ را نكاشته و براى مامورين و حكام خراسان فرستاد كه هر كجا او را ديدند به حضرت روانه دارند ) در حدود 403 شيخ الرئيس از بخارا و خوارزم عزيمت عراق كرد و مشهور چنين است كه چون نمىخواست بنا بدرخواست سلطان محمود غزنوى بغزنين رود به قصد پيوستن به خدمت امير شمس المعالى قابوس بجرجان حركت كرد ولى در ضمن راه شنيد كه قابوس را محبوس و مقتول كرده‌اند و اتفاقا در طى اين سفر ابو على سينا دچار صدمات بسيار شده و از همه بدتر در دهستان به سختى ناخوشى عارض او گرديد و بالاخره خود را بجرجان رساند و مدتى براى استراحت و رفع كسالت در اين شهر ماند و در مدت اين اقامت قسمت اول كتاب قانون و كتاب المجستى را تحرير كرد بعد از جرجان برى رفت و در خدمت سيده زن فخر الدوله ديلمى و مادر مجد الدوله رسيد و مدتى در خدمت ايشان بود سپس از رى بهمدان رفت و بوزارت شمس الدوله بويه اختيار شد و در اين مدت بواسطه شورش لشكريان و مخالفت ايشان با شيخ الرئيس حكيم مزبور در حبس افتاد و لشكريان قصد قتل او را داشتند ولى شيخ الرئيس مدت چهل روز در منزل يكى از دوستان خود مخفى شد و بعد از اينكه شورش لشكريان خوابيد شمس الدوله